Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms