Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm5538W4VSP6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm5538W4VSP6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm5538W4VSP6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm5538W4VSP6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm5538W4VSP6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm5538W4VSP6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm5538W4VSP6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm5538W4VSP6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm5538W4VSP6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm5538W4VSP6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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