Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms