Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ5

Tnni1, Troponin I, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni1Q9WUZ5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms