Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms