Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms