Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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Trpc3Q9QZC1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms