Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp5Q9JKD3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms