Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms