Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms