Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifitm3Q9CQW9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms