Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms