Protein–RNA interactions for Protein: Q99K01

Pdxdc1, Pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdxdc1Q99K01 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdxdc1Q99K01 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms