Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2J7

Rell1, RELT-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rell1Q8K2J7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rell1Q8K2J7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms