Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Nek9Q8K1R7 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Nek9Q8K1R7 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Nek9Q8K1R7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek9Q8K1R7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms