Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms