Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmco3Q8BH01 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmco3Q8BH01 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmco3Q8BH01 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmco3Q8BH01 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmco3Q8BH01 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmco3Q8BH01 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco3Q8BH01 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco3Q8BH01 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco3Q8BH01 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco3Q8BH01 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco3Q8BH01 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco3Q8BH01 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco3Q8BH01 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco3Q8BH01 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco3Q8BH01 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco3Q8BH01 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco3Q8BH01 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco3Q8BH01 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco3Q8BH01 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco3Q8BH01 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco3Q8BH01 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco3Q8BH01 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco3Q8BH01 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms