Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms