Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih3Q6ZWS4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms