Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms