Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrhQ62361 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrhQ62361 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrhQ62361 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrhQ62361 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrhQ62361 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrhQ62361 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrhQ62361 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrhQ62361 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrhQ62361 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrhQ62361 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrhQ62361 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrhQ62361 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TrhQ62361 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrhQ62361 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TrhQ62361 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrhQ62361 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrhQ62361 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms