Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms