Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna2Q61301 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctnna2Q61301 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctnna2Q61301 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms