Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms