Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Sin3aQ60520 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms