Protein–RNA interactions for Protein: Q5ZPR3

CD276, CD276 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD276Q5ZPR3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD276Q5ZPR3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms