Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TefmQ5SSK3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TefmQ5SSK3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TefmQ5SSK3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TefmQ5SSK3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TefmQ5SSK3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TefmQ5SSK3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TefmQ5SSK3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TefmQ5SSK3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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