Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms