Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Trp53i11Q4QQM4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Trp53i11Q4QQM4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Trp53i11Q4QQM4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Trp53i11Q4QQM4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Trp53i11Q4QQM4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Trp53i11Q4QQM4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Trp53i11Q4QQM4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Trp53i11Q4QQM4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Trp53i11Q4QQM4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Trp53i11Q4QQM4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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