Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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