Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms