Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms