Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PrkcqQ02111 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PrkcqQ02111 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms