Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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