Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SbdsP70122 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SbdsP70122 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SbdsP70122 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SbdsP70122 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SbdsP70122 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SbdsP70122 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbdsP70122 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbdsP70122 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SbdsP70122 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SbdsP70122 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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