Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpbP50405 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpbP50405 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SftpbP50405 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SftpbP50405 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SftpbP50405 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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SftpbP50405 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpbP50405 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SftpbP50405 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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