Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms