Protein–RNA interactions for Protein: P21440

Abcb4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb4P21440 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcb4P21440 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 192.8 ms