Protein–RNA interactions for Protein: P01896

H-2 class I histocompatibility antigen, alpha chain (Fragment), mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01896 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01896 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01896 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01896 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01896 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01896 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01896 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01896 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01896 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01896 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01896 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01896 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01896 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01896 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01896 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01896 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01896 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01896 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01896 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01896 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01896 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01896 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01896 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01896 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01896 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01896 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01896 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01896 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01896 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01896 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01896 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01896 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01896 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01896 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01896 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01896 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01896 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01896 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01896 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01896 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01896 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01896 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01896 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01896 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01896 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01896 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01896 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01896 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01896 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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