Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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