Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stag2O35638 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stag2O35638 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stag2O35638 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stag2O35638 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stag2O35638 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag2O35638 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms