Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms