Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms