Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Cldn6Q9Z262 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Cldn6Q9Z262 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Cldn6Q9Z262 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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