Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms