Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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