Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

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Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rapgef4Q9EQZ6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rapgef4Q9EQZ6 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rapgef4Q9EQZ6 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rapgef4Q9EQZ6 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rapgef4Q9EQZ6 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rapgef4Q9EQZ6 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rapgef4Q9EQZ6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rapgef4Q9EQZ6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rapgef4Q9EQZ6 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rapgef4Q9EQZ6 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rapgef4Q9EQZ6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rapgef4Q9EQZ6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rapgef4Q9EQZ6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rapgef4Q9EQZ6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rapgef4Q9EQZ6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rapgef4Q9EQZ6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rapgef4Q9EQZ6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rapgef4Q9EQZ6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rapgef4Q9EQZ6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms