Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms