Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb4aQ9D6F9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms