Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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